La Faculté des arts et des sciences de l'Université de Montréal
L’accord avec la faculté des arts et sciences de l'Université de Montréal été signé en 2014. Il permet aux étudiants et aux élèves de l'École nationale des chartes de candidater à un séjour d'études d'un semestre à Montréal.
L'École de bibliothéconomie et des sciences de l’information à Montréal

L’Accord avec l’École de bibliothéconomie et des sciences de l’information (EBSI- Université de Montréal : Canada) offre la possibilité pour deux étudiants ayant terminé leur Master Technologie Numérique Appliquée à l’Histoire de poursuivre leurs études à l’EBSI de l'Université de Montréal, sur la base d’un programme particulier. Ils obtiennent en un an au lieu de deux le diplôme de MSI de l'EBSI.
La conférence des recteurs et des principaux des universités du Québec
L'École nationale des chartes a renouvelé en 2013 son accord d'échange d'étudiants avec la Conférence des recteurs et des principaux des universités du Québec (CREPUQ).
Grâce à ce programme d’échanges, les étudiants et élèves de l'École nationale des chartes peuvent candidater à un semestre d'études dans l'une des universités québécoises membre de la CREPUQ.
La Newberry library à Chicago

Chaque année, un doctorant de l’École ou un ancien élève diplômé de l’Énc peut se porter candidat pour faire des recherches dans le fonds ancien de la Newberry library durant un mois et bénéficier d’une bourse délivrée par la Newberry Library. La direction de l’Énc sélectionne le candidat et transmet son dossier à la direction de la bibliothèque américaine. L’Énc accueille en contrepartie un(e) étudiant(e) américain(e) pendant trois mois et lui verse également une bourse.
La Historic New Orleans Collection

Depuis 2011, l’Énc envoie tous les ans deux élèves à La Nouvelle Orléans afin d’y effectuer leur stage à l’étranger et de travailler sur un projet de recherche spécifique. Les élèves sont logés et bénéficient d’une bourse délivrée par la HNOC. L’École envoie également chaque année un élève du Master TNAH en stage obligatoire pour 3 mois à la HNOC où l’étudiant bénéficie d’un logement et d’une bourse offerts par la HNOC.
L'École de communication et des arts de l'Université de São Paulo au Brésil

L’accord avec l'École de communication et des arts de l'Université de São Paulo a été signé en 2016. Il permet aux étudiants, doctorants et aux élèves de l'École nationale des chartes et d'effectuer à un séjour d'études ou de recherche à São Paulo.